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第三方物流企业创新能力主要体现为：一是体制创新，对我国大多数传统物流企业来讲，可以通过资产重组、股份制改造、合资合作等方式来完善公司治理结构，实现企业体制创新。二是组织创新，建立基于信息平台的、具有快速反应能力的扁平化物流组织结构，以适应过程化管理和决策权限前移及分散的需要。三是服务内容创新，从单一功能性的服务，扩展到基于核心业务能提供整个物流方案的实施服务。四是管理方式的创新，如提供电子商务物流服务、定制服务、“门到门”服务、“套餐”服务等。
1、信息化系统
核心竞争力是在企业演进过程中经过长时间知识、技术和人才积累逐渐形成的，先进技术尤其是信息技术的应用则是三方企业核心竞争力的主要标志。
现代信息技术的广泛应用，大大降低了物流过程的交易费用、资源的整合成本，提高了服务的响应速度、运作的便捷与效率，条码与自动识别技术具有数据高速自动输入、高读取率、低误读率、容易操作、设备投资低等优点，有效解决物流数据采集、录入、处理、传输“瓶颈”的工具。
2、资源整合
任何物流活动的开展对社会交通运输、仓储、物流公共设施、信息及社会物流环境等有很强的。因此，如何整合物流资源是第三方企业核心竞争力的关键内容。
基于企业战略定 位的物流资源整合，可以有效地获得战略性经营资产，完善物流服务功能，充分利用社会资源，创造良好的外部环境，提高物流效率。
第三方企业的资源整合范围可分为：内部资源和外部资源。内部资源主要有人力、设备设施、信息、资金、无形资产等；外部资源主要包括用户、供应商、投资商、政府、标准组织、咨询机构等。
从资源整合的对象来看，可分为客户资源整合、能力资源整合、信息资源整合。从整合的方式来看，可分为兼并重组、合资合作、协议联盟、租赁托管、建立信息共享或交易平台等。
3、运营能力
由于物流服务是不可储存的，服务过程就是客户的消费过程，任何差错都会对客户产生不良影响，物流企业只有具备较高的业务运作能力，才能实现低成本高水平服务的目的。因此，物流运作能力是物流企业基本、不可或缺的能力，是物流企业竞争优势的基本体现。
物流业务运作的内容可分为三个层次：一是整套物流实施方案的运作能力，这要求各功能业务相互配合，紧密衔接，运转，保证整个流程低成本进行。二是具体物流功能业务的运作，这要求具体物流功能内部的各作业环节，运作、准确、安全。三是具体作业(操作)的运作，具体包括制定科学的工作与作业方法，确定先进的作业时间定额和操作规范等。
